作为一名血液科医生,在我的实际工作中,经常会有患者问:医生,融合基因我已经做过了,RNA seq这个检查有必要做吗?
那么下面就分享一例病例说明:
病例分享:患儿,女,13岁。
诊断:急性B淋巴细胞白血病。
病情简介:患儿2020年03月无明显诱因出现下肢皮肤出血点,逐渐遍及面部及胸部,伴乏力,食欲下降,无其他不适,查血常规:白细胞6.5×10^9/L,血红蛋白72g/L、血小板13×10^9/L;骨髓检查;急性B淋巴细胞白血病(染色体核型:47,XX,add(12)(p12),+mar[10];常见融合基因筛查及PH样急性淋巴细胞白血病基因均阴性)。给予规律化疗,白血病得到流式细胞术检测残留白血病阴性缓解(免疫学水平缓解)。于起病1年左右时,患儿中枢复发,给予鞘内注射联合CD19-CART、CD22-CART、补给化疗及其他免疫治疗,并行中枢放疗,本病骨髓及中枢白血病再次持续缓解约1年左右的时间,后本病再次骨髓及中枢全面复发。
重新评估:此次复发后,患儿收入我科,收入我科后,建议患儿家长完善白血病相关检查、包括遗传学及基因学检查。因为患儿外周血肿瘤细胞比例很高,所以以下检查都是用外周血送检的。具体结果如下:
细胞形态学:
流式细胞术:
20.81%(占全部细胞)的CD19+/ CD45dim+细胞,表达CD22、CD10 、HLA-DR、CD58、CD81和CD38,部分表达CD34,不表达CD20、CD123、CD14、CD7,为异常幼稚B淋巴细胞。
染色体及FISH:
47,XX,+8,?t(9;14)(p13;q11),del(17)(p11),inc[cp17]/46,XX[3]FISH:P53缺失
基因学:RNA seq
MEF2D-HNRNPUL1融合变异阳性
血液肿瘤基因突变:未查到有效基因突变。
治疗:患儿入我科后,查脑脊液提示中枢神经系统白血病,给予全身化疗的同时进行多次鞘内注射化疗药物治疗中枢神经系统白血病。由于患儿白血病细胞仍然表达CD19,故再次给予人源CD19-CART细胞治疗,其间患儿发生1级CRS,CART半月及一个月时左右复查骨髓均达到了基因水平的缓解。
目前已完成异基因造血干细胞移植,复查骨髓及脑脊液均为基因水平的完全缓解。
这个病例看似就是一例CART治疗复发难治的B急淋的成功案例,虽然这样的病例在我们中心并不在少数,但是我想特别强调的是:这个病人末次复发时在我们这里做的疾病的重新评估,使得我们对患儿的疾病得到了重新的认知,这或许能够解释其为什么多次复发而且在序贯CART后仍然复发的可能原因,并且为患儿在后续治疗中提供了可能有效的治疗靶点及疾病治疗疗效的最为敏感的追踪指标。
在这里简单文献学习一下ME
F2D相关的融合基因:这类融合基因在急性淋巴细胞白血病中的大概发生率2%-5%,其常见的伙伴基因包括:BCL9, CSF1R, DAZAP1, HNRNPUL1 and SS18,其中BCL9最为常见。发生这类融合基因变异的病人,通常发病年龄偏大、具有独特的免疫表型、基因拷贝数的改变,提示预后不良,有可能从组蛋白去乙酰化酶抑制剂治疗中获益。